早在15000年前的人類文明中，地球上高度智能的科斯莫斯就被兩個類似昆蟲的大型怪物——莫斯拉和巴特拉摧毀了。然而，在一次山體滑坡之后，被掩埋的摩斯拉巨蛋是從現(xiàn)在的日本伊法那島上挖掘出來的。然后，歷史上最強大的三個怪物——哥斯拉、莫斯拉和巴特拉相遇并決斗。盡管怪物莫斯拉和巴特拉成功地將哥斯拉一起封印在了海里，但人類的危機并沒有得到解決，因為一顆巨大的隕石將撞擊地球