中途相遇的富家子弟郝小文（郝少文飾演）和他的“女仆”丑妹妹，以及先后到達的石小寶和小英，進入了忍者學校學習。以盈利為導向的忍者學校為小文打開了大門，但小寶和小英不得不依靠自己的實力爭取錄取機會。四位新同學在忍者老師一元（吳孟達飾演）和二次的指導下開始學習忍者。這些頑皮的孩子在生活和學習的各個方面都不忘尋找惡作劇的機會，讓學習劍、潛水和吃飯變成了鬧劇。催淚瓦斯已經成為他們哭泣和賺取外快的絕密武器。就連校長（黃一飛）也被他們打敗了。一天，一位自稱是絕世忍者的叔叔參觀了一所忍者學校。十年前，他在一次忍者比賽中失利后摔倒了，多年來一直努力尋找他的宿敵。然而，他當時的對手實際上是一位一元錢的老師。他應該如何處理叔叔請求幫助的四個小家伙？