在入侵者伊爾米達斯占領下從地球逃離阿卡迪亞的哈洛克（s-00999）、小山泰一郎（s-00998）和祖母綠（x-00001）被通緝?yōu)檎麄€太空的代號SSX，并在被伊爾米達軍隊襲擊時，與外星人的La mime的同伴一起繼續(xù)尋找被認為是大宇宙中某個地方的烏托邦阿卡迪亞。在戰(zhàn)斗中，巴里博士以地球男孩、女孩利維、Yuki和船醫(yī)的身份加入了小組。另一方面，銥地占領軍命令年輕的天才科學家zone先生分析阿卡迪亞號，以便在阿卡迪亞號之外建造一艘船。zone先生也來到了偉大的太空，并瞄準了阿卡迪亞。