X檔案關(guān)閉后，穆德（大衛(wèi)·杜喬夫尼飾）和斯科利（吉莉安·安德森飾）被分開(kāi)。穆德受命擔(dān)任班長(zhǎng)，斯科利回到學(xué)院學(xué)習(xí)。一天，國(guó)會(huì)議員馬特森（雷蒙德·J·巴里飾）向穆德透露了一條信息，稱他收到了波多黎各外星人的信息。為了在特種部隊(duì)面前找到外星人的證據(jù)，穆德獨(dú)自前往。得知這一消息的斯科利趕到穆德的住所，從電腦中的乘客名單中找到線索，并跟隨她前往波多黎各。但這名男子不久就去世了。穆德最終能找到外星人來(lái)訪的證據(jù)嗎？