哥斯拉落入三元山后，日本過了五年平靜的生活，但自衛(wèi)隊(duì)打算利用哥斯拉的細(xì)胞制造對(duì)付哥斯拉，以防萬一；抗核細(xì)菌；（ANB），以及在與哥斯拉的戰(zhàn)爭(zhēng)中被摧毀的超級(jí)武器；超級(jí)_ X”；轉(zhuǎn)換為“；超級(jí)X2”此時(shí)，哥斯拉實(shí)際上在三元山再次開始移動(dòng)，這在日本關(guān)東引發(fā)了地震，并導(dǎo)致白神博士殺死了與他的女兒細(xì)胞和玫瑰細(xì)胞混合的植物。因此，白神博士加入了ANB計(jì)劃，他將哥斯拉細(xì)胞與混合了她的女兒細(xì)胞和玫瑰細(xì)胞的植物結(jié)合在一起，創(chuàng)造了不朽的植物Biolanti。但在一次事件中，Biolanti被釋放，并在里德湖變得巨大。此時(shí)，哥斯拉在三元山爆炸后再次出現(xiàn)。自衛(wèi)隊(duì)無法阻止哥斯拉向東京進(jìn)發(fā)，隨后派出了"；超級(jí)X2”；讓哥斯拉改變運(yùn)動(dòng)方向，但在哥斯拉的持續(xù)攻擊下"；Super X2也被擊敗了，但哥斯拉沒想到此時(shí)會(huì)向比奧蘭蒂的位置移動(dòng)