正當Keroro團隊邁向電視動畫的第四年時，他們的第二部劇場版《超級劇場版Keroro的深海公主，是的！》即將于3月17日在日本開播。在第一部宣揚最高級別“友誼”的劇場版結束后，這部劇場版將大力宣揚家庭的大愛。最后，水行星馬龍開始入侵地球。馬龍的最后一個后裔梅魯王子和他的隨行人員馬魯在一起生活了兩年，他們決定重建他們的世界，因此他們開始尋找公主的候選人。被選中的是玄南宗家的長女，她住在Keroro的小團隊里！Keroro和他的團隊開始向深海所在的秘密王國出發(fā)，營救被綁架的夏梅。