在旅行的火車(chē)上，梅雪（鈴木由紀(jì)飾演）再次遇到金田一（松本潤(rùn)飾演）并跟隨他。同伴們用他們的DVD記錄下發(fā)生的一切。一天晚上，一個(gè)傀儡首領(lǐng)不幸被殺。事件發(fā)生后，偵探們發(fā)現(xiàn)他原來(lái)在車(chē)廂里的尸體不見(jiàn)了，引起了騷動(dòng)。偵探?jīng)Q定暫時(shí)住在一家酒店里尋找嫌疑人，金田等人也去了那里。后來(lái)，根據(jù)案件的具體情況，嫌疑人被鎖定在木偶小組的成員中，偵探想通過(guò)測(cè)量他的體重來(lái)縮小搜索范圍。然而，一名女性成員的意外死亡讓金田發(fā)現(xiàn)了一個(gè)隱藏的秘密，從而揭開(kāi)了一個(gè)長(zhǎng)期案件的真相。。。這部電影改編自天書(shū)正魯?shù)穆?huà)。除了上面提到的魔火車(chē)殺人事件特輯，它還包括以下六個(gè)事件：幽靈客輪謀殺案、法國(guó)銀幣謀殺案、黑死蝶謀殺案和快水靈香綁架案魔森林謀殺案和盧錫安類(lèi)人謀殺案。